報告題目：基于深度學習的單細胞標注

報 告 人：鄧明華（北京大學數學科學學院）

報告時間：2022年5月10日下午3:00-4:00

報告形式：騰訊會議ID：468-751-569

內容簡介：隨著單細胞人類細胞圖譜(HCA)等大型研究計劃的進行，大量的RNA測序數據集得以累積，這些大型單細胞測序數據可以作為目標研究的參考。然而，由于數據集之間的批次效應(Batch Effect)，使得基于參考數據的學習變得困難。本報告將介紹課題組最近開發的兩個算法scSemiCluster和scMRA. 前者考察從單個參考數據、后者考察從多個參考數據到目標數據的標注遷移問題；算法將深度學習與統計相結合，將數據降維到低維非線性流形上，同時挖掘了不同細胞類型之間的結構關系，在實現目標數據精確標注的同時，能夠有效去除不同數據之間的批次效應。

報告人簡介：鄧明華，北京大學數學科學學院教授。1987年9月-1998年1月在北京大學數學學院學習，畢業后留校工作至今。2003年8月晉升為副教授，2006年任博士生導師，2009年8月晉升為教授。其間2001年2月－2003年8月在美國南加州大學計算分子生物學中心從事博士后研究，2009年8月-2010年1月美國耶魯大學訪問副教授。鄧明華從事生物信息學研究，發表SCI論文80余篇。曾先后主持6項自然科學基金面上項目和1項863項目，參加3項973項目和2項科技部重點研發項目。

（撰稿人：雷錦志；審稿人：郭永峰）

數學科學學院

2022年5月7日